Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbp4Q00724 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbp4Q00724 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms