Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apoa1Q00623 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apoa1Q00623 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms