Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pax8Q00288 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms