Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

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Length 3,329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Brca2P97929 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Brca2P97929 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Brca2P97929 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Brca2P97929 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Brca2P97929 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Brca2P97929 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Brca2P97929 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Brca2P97929 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brca2P97929 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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