Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IhhP97812 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IhhP97812 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IhhP97812 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IhhP97812 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IhhP97812 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IhhP97812 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IhhP97812 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IhhP97812 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IhhP97812 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms