Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cry1P97784 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cry1P97784 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms