Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cited1P97769 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cited1P97769 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cited1P97769 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms