Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
rp9P97762 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
rp9P97762 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
rp9P97762 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
rp9P97762 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
rp9P97762 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
rp9P97762 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
rp9P97762 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
rp9P97762 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
rp9P97762 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
rp9P97762 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
rp9P97762 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
rp9P97762 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
rp9P97762 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms