Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas2P97460 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas2P97460 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas2P97460 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms