Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3f3aP84244 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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