Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HpcaP84075 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HpcaP84075 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HpcaP84075 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms