Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irx2P81066 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx2P81066 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms