Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Surf6P70279 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms