Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf5P70191 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf5P70191 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf5P70191 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf5P70191 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf5P70191 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf5P70191 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf5P70191 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf5P70191 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf5P70191 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf5P70191 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms