Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn5P68500 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn5P68500 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms