Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crip1P63254 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms