Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps3P62908 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms