Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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