Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms