Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ufm1P61961 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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