Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Depdc5P61460 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Depdc5P61460 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms