Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PlnP61014 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PlnP61014 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PlnP61014 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PlnP61014 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms