Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sem1P60897 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sem1P60897 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms