Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ActbP60710 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ActbP60710 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ActbP60710 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ActbP60710 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ActbP60710 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ActbP60710 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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