Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms