Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms