Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bace1P56818 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms