Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmoP56726 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmoP56726 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmoP56726 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmoP56726 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmoP56726 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SmoP56726 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SmoP56726 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SmoP56726 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SmoP56726 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SmoP56726 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmoP56726 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmoP56726 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms