Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lim2P56563 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms