Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf5P56477 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf5P56477 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf5P56477 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms