Protein–RNA interactions for Protein: P56391

Cox6b1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6b1P56391 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cox6b1P56391 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms