Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atp5eP56382 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms