Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms