Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh5P55284 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh5P55284 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh5P55284 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh5P55284 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh5P55284 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdh5P55284 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms