Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms