Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CnbpP53996 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CnbpP53996 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms