Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HccsP53702 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HccsP53702 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HccsP53702 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HccsP53702 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HccsP53702 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HccsP53702 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HccsP53702 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HccsP53702 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HccsP53702 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HccsP53702 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HccsP53702 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HccsP53702 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HccsP53702 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HccsP53702 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HccsP53702 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HccsP53702 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms