Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cux1P53564 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms