Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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