Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox5P52651 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms