Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TspoP50637 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TspoP50637 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TspoP50637 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TspoP50637 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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