Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TubP50586 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TubP50586 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TubP50586 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TubP50586 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TubP50586 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TubP50586 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TubP50586 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TubP50586 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TubP50586 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TubP50586 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TubP50586 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms