Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms