Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms