Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl5P50228 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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