Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc3P49135 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc3P49135 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms