Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3P48787 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms