Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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