Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GdnfP48540 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GdnfP48540 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GdnfP48540 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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