Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RpiaP47968 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RpiaP47968 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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